Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CASC15-204ENST00000606197 3969 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN5-202ENST00000394170 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NPHS1-202ENST00000378910 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-208ENST00000372440 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 COL11A1-202ENST00000358392 7327 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC8.41□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 YEATS2-201ENST00000305135 6506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 EPB41L4A-201ENST00000261486 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 NBN-201ENST00000265433 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 HDGFL3-201ENST00000299633 12733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
RETNLBQ9BQ08 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms