Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCDC112Q8NEF3 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 SPATA2-202ENST00000422556 4138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC112Q8NEF3 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms