Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
TCF23Q7RTU1 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms