Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
IMPG1Q17R60 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MRVI1-216ENST00000547195 6155 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 FNIP1-205ENST00000615660 6589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
IMPG1Q17R60 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms