Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NEK6-205ENST00000394199 2535 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 AL713866.1-201ENST00000563320 3125 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
LSAMPQ13449 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GGPS1-202ENST00000358966 2740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PCDHGA7-202ENST00000617050 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BBOF1-201ENST00000394009 3106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ITPRIP-203ENST00000358187 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01254-202ENST00000567609 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SPACA6P-AS-201ENST00000602324 3962 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC00452-202ENST00000609661 2896 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 BX537318.2-201ENST00000624893 4162 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SORBS2-203ENST00000319471 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CYTH2-213ENST00000620214 2020 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DNAI2-201ENST00000311014 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SYPL2-201ENST00000369872 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 STAT6-203ENST00000537215 2886 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 TMX1-201ENST00000457354 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 ACLY-204ENST00000537919 2974 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 SYBU-222ENST00000529175 2717 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
LSAMPQ13449 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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