Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2FP61218 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms