Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 MED7-202ENST00000420343 1382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
PROK1P58294 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
PROK1P58294 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
PROK1P58294 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
PROK1P58294 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms