Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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LRIT1Q9P2V4 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP000244.1-201ENST00000424582 201 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC106869.1-201ENST00000448713 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
LRIT1Q9P2V4 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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