Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 UGT1A12P-201ENST00000447084 853 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 AC012617.1-202ENST00000586488 509 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ERAS-202ENST00000636362 826 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXQ1Q9C009 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SULT1A3-201ENST00000338971 1097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms