Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 IQCF1-201ENST00000310914 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MIR181D-201ENST00000384853 137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC064853.1-201ENST00000413096 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 MXRA7-204ENST00000585519 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CHD2-218ENST00000629346 1249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPN18Q99952 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AL031577.1-201ENST00000339867 399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 U3.41-201ENST00000408711 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC078882.1-201ENST00000436132 416 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 RN7SL646P-201ENST00000492969 297 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 CLP1-202ENST00000525602 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPN18Q99952 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms