Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RN7SL47P-201ENST00000488710 299 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC092535.4-201ENST00000609548 397 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC007389.3-201ENST00000420724 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DDX11L1-202ENST00000456328 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DDX11L10-202ENST00000513886 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DDX11L9-203ENST00000562189 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FTH1P18-201ENST00000412071 549 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC006328.1-201ENST00000437571 379 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC007679.1-201ENST00000458609 502 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 YBX1P3-201ENST00000468366 909 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AP001102.1-201ENST00000528959 409 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 TCP1-215ENST00000544255 1403 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SIRT1Q96EB6 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 RPL38-202ENST00000439590 431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC100858.2-201ENST00000531948 487 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL137028.2-201ENST00000614601 256 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SIRT1Q96EB6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms