Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 AL050341.2-201ENST00000567508 1541 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
P3H3Q8IVL6 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P3H3Q8IVL6 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms