Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STRIP1Q5VSL9 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 MPZL3-204ENST00000527472 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STRIP1Q5VSL9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms