Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SULT2A1-201ENST00000222002 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TTC39B-201ENST00000297615 3053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SH2D3C-202ENST00000373276 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 RBM22P2-201ENST00000393978 1814 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EHMT2-203ENST00000375537 3965 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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SIX1Q15475 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SIX1Q15475 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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