Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
E2F1Q01094 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms