Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 IGHMBP2-201ENST00000255078 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SCN3B-206ENST00000530277 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LPIN1-209ENST00000449576 3077 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ESPNL-206ENST00000612395 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC068775.1-201ENST00000322446 2142 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ZNF501-201ENST00000396048 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CTBP2-201ENST00000309035 3669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CNOT4-203ENST00000361528 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 FDXACB1-201ENST00000260257 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NANP-201ENST00000304788 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PNMA6F-201ENST00000436629 3348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 TMEM169-202ENST00000406027 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CBX1P83916 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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