Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
ERVS71-1P61550 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ERVS71-1P61550 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms