Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC005154.3-201ENST00000419639 1393 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCCD1P59942 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms