Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RHBDL3P58872 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms