Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
AP3M2P53677 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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