Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC3P51654 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC3P51654 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC3P51654 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GPC3P51654 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GPC3P51654 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms