Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 AC105415.1-201ENST00000509015 1416 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 AC023590.1-202ENST00000366457 781 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 ANO7-203ENST00000402530 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 RPS15P5-201ENST00000449885 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 COPZ1-207ENST00000549116 736 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NESP48681 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 MGLL-202ENST00000398101 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 VOPP1-217ENST00000625836 1400 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 ZP4-201ENST00000366570 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 AC233724.7-201ENST00000511476 253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 AL138828.1-208ENST00000585946 824 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 AL355353.1-201ENST00000604014 330 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NESP48681 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 CAMK2B-202ENST00000346990 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 CABYR-203ENST00000399496 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 PPATP1-201ENST00000496669 1547 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AC253536.2-201ENST00000423307 254 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AC004870.4-202ENST00000433337 455 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AC106748.1-201ENST00000454801 384 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AC023886.1-202ENST00000504009 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AC018755.1-201ENST00000601315 1182 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AC009061.2-202ENST00000602596 696 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 FAM92B-203ENST00000629253 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NESP48681 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 SERF2-210ENST00000409960 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 ART2P-201ENST00000415521 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 TRBV22-1-201ENST00000424543 337 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 MED15P7-201ENST00000435410 822 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 AL662860.1-201ENST00000436804 877 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 NKAPP1-203ENST00000554109 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 KRT16P4-202ENST00000580052 362 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 METTL23-211ENST00000589977 617 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 AC090093.1-201ENST00000611315 271 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 CNMD-201ENST00000377962 1410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 JAML-202ENST00000356289 1944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NESP48681 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NESP48681 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NESP48681 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NESP48681 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms