Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXA13P31271 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms