Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 MIER2-201ENST00000264819 6884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ITGA3P26006 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ITGA3P26006 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms