Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ELOVL6-201ENST00000302274 3090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC8A3-207ENST00000528359 2840 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC8A3-210ENST00000534137 2837 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NAPB-201ENST00000377026 3837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 IKZF4-202ENST00000431367 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GAB2-201ENST00000340149 6052 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC092902.2-210ENST00000468859 1996 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 KCNA4-201ENST00000328224 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CEP170-203ENST00000366543 6727 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SRRM5-201ENST00000417606 2381 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TBC1D16-201ENST00000310924 10936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TMEM74B-201ENST00000381894 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZNF287-201ENST00000395824 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 FURIN-201ENST00000268171 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 NOSTRIN-203ENST00000397209 1437 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ANKDD1A-201ENST00000319580 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CACNA1C-205ENST00000399591 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CACNA1C-206ENST00000399595 6535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CDH4-203ENST00000614565 6513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SLC23A1-202ENST00000353963 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ZEB2-239ENST00000637045 9091 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GLO1-201ENST00000373365 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 ROBO2-209ENST00000487694 5919 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 CH25H-201ENST00000371852 1686 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 TGOLN2-202ENST00000377386 6489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
IFITM1P13164 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms