Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DRAM1-201ENST00000258534 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ABCA2-223ENST00000614293 8146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SLC36A4-201ENST00000326402 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SLC25A18-202ENST00000399813 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 GOLGA6L4-203ENST00000510439 4563 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 S1PR1-201ENST00000305352 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AP002008.2-201ENST00000635926 4870 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AC018445.4-201ENST00000624066 2291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 CACNB1-212ENST00000622445 3722 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ATP8A1-202ENST00000381668 8270 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PDE7B-201ENST00000308191 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTMAP06454 VDR-202ENST00000395324 4762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PTMAP06454 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 BTBD3-203ENST00000399006 4826 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 SRP72-205ENST00000510663 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTMAP06454 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms