Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LINC00484-201ENST00000414768 561 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC004969.1-201ENST00000471553 578 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RPSAP6-201ENST00000417882 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVV-1B6SEH8 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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