Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARL2-SNX15V9GYD0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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