Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJA3Q9Y6H8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GJA3Q9Y6H8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms