Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00312Q9Y6C7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00312Q9Y6C7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms