Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD54BQ9Y620 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD54BQ9Y620 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms