Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF3AQ9Y496 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF3AQ9Y496 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF3AQ9Y496 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms