Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TPRKBQ9Y3C4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPRKBQ9Y3C4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms