Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EMC9Q9Y3B6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EMC9Q9Y3B6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms