Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRG3Q9Y2Y8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRG3Q9Y2Y8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms