Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP20Q9Y2K6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP20Q9Y2K6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP20Q9Y2K6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms