Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHMP2BQ9UQN3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHMP2BQ9UQN3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms