Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HDAC5Q9UQL6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HDAC5Q9UQL6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms