Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM33Q9UPN9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM33Q9UPN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms