Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC12A4Q9UP95 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC12A4Q9UP95 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC12A4Q9UP95 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms