Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PADI4Q9UM07 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
PADI4Q9UM07 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms