Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMCO1Q9UM00 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMCO1Q9UM00 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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