Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TPCN1Q9ULQ1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TPCN1Q9ULQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TPCN1Q9ULQ1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
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