Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNOT6Q9ULM6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNOT6Q9ULM6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNOT6Q9ULM6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms