Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RARRES3Q9UL19 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RARRES3Q9UL19 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms