Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SCP2D1Q9UJQ7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SCP2D1Q9UJQ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms