Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD1Q9UIS9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MBD1Q9UIS9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms