Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
COPS7AQ9UBW8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
COPS7AQ9UBW8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
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