Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC88CQ9P219 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC88CQ9P219 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms