Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HMG20BQ9P0W2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
HMG20BQ9P0W2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HMG20BQ9P0W2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms